一键安装此套包中的所有插件:
42plugin install anthropics/kit/life-sciencesanthropics
生成医疗设备或药物的临床试验协议。可用于创建协议、设计临床研究或开发FDA提交文档。
anthropics
将实验室仪器输出文件(PDF、CSV、Excel、TXT)转换为 Allotrope 简单模型(ASM)JSON 格式或扁平化 2D CSV,便于标准化仪器数据以供 LIMS 系统、数据湖或后续分析使用。
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使用 scvi-tools 进行深度学习的单细胞分析,支持数据整合、批次校正、ATAC-seq、CITE-seq、多组学分析及空间转录组去卷积等多种功能。
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该插件帮助科学家选择研究问题、构思项目、解决项目难题或进行战略决策。适用于用户提出新研究想法、评估项目风险或规划研究策略时的需求。
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在测序数据上运行 nf-core 生物信息学管道(如 RNA-seq、Sarek、ATAC-seq)。适用于分析 RNA-seq、WGS/WES 或 ATAC-seq 数据,支持本地 FASTQ 文件或来自 GEO/SRA 的公共数据集。
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使用scverse最佳实践对单细胞RNA-seq数据(.h5ad或.h5文件)进行质量控制,提供基于MAD的过滤和全面可视化。适用于用户请求质控分析、过滤低质量细胞、评估数据质量或遵循单细胞分析的最佳实践。