科学研究技能包

包含多种科研相关插件,如文献管理、演示幻灯片生成、医疗方案设计等,适合科研人员、学生及学术会议参与者使用,提升科研效率与成果传播。

一键安装此套包中的所有插件:

42plugin install k-dense-ai/kit/claude-scientific-skills

包含的插件(134)

LaTeX模板访问助手

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Skill

访问主要科学出版场所(如 Nature、Science、PLOS、IEEE、ACM)、学术会议(如 NeurIPS、ICML、CVPR、CHI)、研究海报和资助提案(如 NSF、NIH、DOE、DARPA)的全面 LaTeX 模板、格式要求和提交指南。

4.7

PubMed数据库直接访问工具

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Skill

直接通过REST API访问PubMed。支持高级布尔/MeSH查询、E-utilities API、批处理、引用管理。对于Python工作流,建议使用biopython(Bio.Entrez)。适用于直接的HTTP/REST工作或自定义API实现。

4.6

科研演示幻灯片生成器

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Skill

构建研究演讲的幻灯片和演示文稿。用于制作 PowerPoint 幻灯片、会议演示、研讨会演讲、研究演示、论文答辩幻灯片或任何科学演讲。提供幻灯片结构、设计模板、时间指导和视觉验证。

4.6

文献引用管理工具

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Skill

全面的学术研究引用管理。搜索 Google Scholar 和 PubMed 中的论文,提取准确的元数据,验证引用,并生成格式正确的 BibTeX 条目。当您需要查找论文、验证引用信息、将 DOI 转换为 BibTeX 时使用此技能。

4.6

学术论文转化工具

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Skill

在将学术论文转换为宣传和演示格式(包括交互式网站(Paper2Web)、演示视频(Paper2Video)和会议海报(Paper2Poster))时使用此技能。用于涉及论文传播、会议准备等任务。

4.6

专业研究海报生成器

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Skill

使用beamerposter、tikzposter或bposter在LaTeX中创建专业的研究海报。支持会议演示、学术海报和科学交流。包括布局设计、配色方案、多列格式、图形集成以及海报特定的最佳实践。

4.5

研究信息查询助手

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Skill

使用Perplexity的Sonar Pro Search或Sonar Reasoning Pro模型通过OpenRouter查找当前研究信息。根据查询复杂性自动选择最佳模型。搜索学术论文、最新研究、技术文档和带有引用的一般研究信息。

4.5

科学图示生成器

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Skill

使用 Nano Banana Pro AI 创建出版质量的科学图表,采用智能迭代优化。使用 Gemini 3 Pro 进行质量审查。仅在质量低于您文档类型的阈值时重新生成。专注于神经网络架构、系统图、流程图、生物学图表等。

4.5

LaTeX研究海报生成器

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Skill

使用 beamerposter、tikzposter 或 baposter 在 LaTeX 中创建专业研究海报。支持会议演示、学术海报和科学传播。包括布局设计、配色方案、多列格式、图形集成以及海报特定的最佳实践。

4.5

医疗治疗方案自动生成器

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Skill

生成简洁(3-4页)、针对性的医疗治疗计划,格式为LaTeX/PDF,适用于所有临床专业。支持一般医疗治疗、康复治疗、心理健康护理、慢性病管理、围手术期护理和疼痛管理。包括SMART目标框架、证据。

4.5

智能网络搜索助手

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Skill

使用Perplexity模型通过LiteLLM和OpenRouter进行AI驱动的网页搜索,获取实时信息。在进行当前信息的网页搜索、查找最新科学文献、获取带有来源引用的准确答案或访问信息时使用。

4.5

机器学习工具集

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Skill

使用scikit-learn进行Python中的机器学习。适用于监督学习(分类、回归)、无监督学习(聚类、降维)、模型评估、超参数调优、预处理或构建机器学习管道。提供全面的参考文档。

4.5

探索性数据分析工具

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Skill

对超过200种文件格式的科学数据文件进行全面的探索性数据分析。当分析任何科学数据文件以了解其结构、内容、质量和特征时使用此技能。自动检测文件类型并生成详细的markdown报告。

4.5

量子计算框架工具

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Skill

量子计算框架,用于构建、模拟、优化和执行量子电路。当处理量子算法、量子电路设计、量子模拟(无噪声或有噪声)、在量子硬件(Google、IonQ、AQT、Pasqal)上运行、量子电路优化时应使用此技能。

4.5

数字病理图像处理工具

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Skill

用于全切片图像(WSI)的数字病理图像处理工具包。当处理组织病理切片、处理 H&E 或 IHC 染色的组织图像、从千兆像素病理图像中提取切片、检测组织区域、分割组织掩膜或准备数据集时使用此技能。

4.5

系统文献综述工具

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Skill

使用多个学术数据库(PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholar等)进行全面的系统文献综述。当进行系统文献综述、荟萃分析、研究综合或跨生物医学领域的全面文献搜索时应使用此技能。

4.4

过程离散事件模拟框架

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Skill

基于过程的离散事件仿真框架(Python)。在构建具有过程、队列、资源和基于时间事件(如制造系统、服务操作、网络流量、物流或任何实体相互作用的系统)的仿真时使用此技能。

4.4

临床决策支持文档生成器

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Skill

为制药和临床研究环境生成专业的临床决策支持(CDS)文档,包括患者队列分析(基于生物标志物的结果)和治疗推荐报告(基于证据的指南和决策算法)。支持GRADE证据。

4.4

神经记录分析工具

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Skill

Neuropixels 神经记录分析。加载 SpikeGLX/OpenEphys 数据,进行预处理、运动校正、Kilosort4 刺激排序、质量指标、Allen/IBL 策划、AI 辅助视觉分析,适用于 Neuropixels 1.0/2.0 的细胞外电生理学。在处理神经记录和刺激排序时使用。

4.4

市场研究报告生成器

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Skill

生成全面的市场研究报告(50+ 页),风格模仿顶级咨询公司(如麦肯锡、波士顿咨询、Gartner)。具有专业的 LaTeX 格式、广泛的视觉生成(科学示意图和生成图像)、与研究查找的深度集成以进行数据收集等功能。

4.4

OpenAlex文献查询工具

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Skill

使用 OpenAlex 数据库查询和分析学术文献。在搜索学术论文、分析研究趋势、查找作者或机构的作品、跟踪引用、发现开放获取出版物或进行文献计量分析时使用此技能。

4.3

DICOM医学影像处理库

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Skill

用于处理 DICOM(医学数字成像与通信)文件的 Python 库。当读取、写入或修改 DICOM 格式的医学影像数据时,提取医学图像的像素数据(CT、MRI、X 射线、超声),匿名化 DICOM 文件,处理 DICOM 元数据时使用此技能。

4.3

分子特征提取工具

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Skill

用于机器学习的分子特征化(100 多种特征提取器)。ECFP、MACCS、描述符、预训练模型(ChemBERTa),将 SMILES 转换为特征,用于 QSAR 和分子机器学习。

4.3

模型解释与可解释性工具

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Skill

使用SHAP(SHapley Additive exPlanations)进行模型可解释性和解释性。当解释机器学习模型预测、计算特征重要性、生成SHAP图(瀑布图、蜜蜂图、条形图、散点图、力图、热图)、调试模型、分析模型偏见时使用。

4.3

资源监测助手

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Skill

在开始任何计算密集型科学任务时使用此技能,以检测和报告可用的系统资源(CPU核心、GPU、内存、磁盘空间)。它创建一个包含资源信息和战略建议的JSON文件,以便为计算方法决策提供信息。

4.3

生物预印本搜索工具

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Skill

高效的 bioRxiv 预印本服务器数据库搜索工具。当通过关键词、作者、日期范围或类别搜索生命科学预印本时使用此技能,检索论文元数据、下载 PDF 或进行文献综述。

4.3

生物信号处理综合工具包

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Skill

全面的生物信号处理工具包,用于分析生理数据,包括ECG、EEG、EDA、RSP、PPG、EMG和EOG信号。在处理心血管信号、大脑活动、电皮肤反应、呼吸模式、肌肉活动或眼动时使用此技能。适用于。

4.3

基因组区间数据处理工具

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Skill

在处理基因组区间数据(BED 文件)进行机器学习任务时使用此技能。用于训练区域嵌入(Region2Vec、BEDspace)、单细胞 ATAC-seq 分析(scEmbed)、构建共识峰(universes)或任何基于 ML 的基因组区域分析。

4.3

BRENDA酶数据库访问助手

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Skill

通过 SOAP API 访问 BRENDA 酶数据库。检索动力学参数(Km、kcat)、反应方程、组织数据和底物特异性酶信息,用于生化研究和代谢途径分析。

4.3

云端Python代码运行平台

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Skill

在云端使用无服务器容器、GPU和自动扩展运行Python代码。适用于部署机器学习模型、运行批处理作业、调度计算密集型任务或提供需要GPU加速或动态扩展的API。

4.3

自动化假设生成助手

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Skill

使用大型语言模型进行自动假设生成和测试。在从数据集中生成科学假设、结合文献见解与实证数据、对观察数据进行假设测试或进行系统假设探索时使用此技能。

4.3

时间序列机器学习助手

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Skill

此技能用于时间序列机器学习任务,包括分类、回归、聚类、预测、异常检测、分割和相似性搜索。适用于处理时间数据、序列模式或需要专门算法的时间索引观察。

4.3

科学写作核心工具

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Skill

深度研究和写作工具的核心技能。以完整段落撰写科学手稿(绝不使用项目符号)。使用两阶段过程:(1)使用research-lookup创建章节大纲和关键点,(2)转换为流畅的散文。IMRAD结构,引用(APA/AMA/Vancouver),图表/表格。

4.3

快速生物信息学查询工具

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Skill

用于快速生物信息学查询的CLI/Python工具包。适用于快速BLAST搜索。访问20多个数据库:基因信息(Ensembl/UniProt)、AlphaFold、ARCHS4、Enrichr、OpenTargets、COSMIC、基因组下载。对于高级BLAST/批处理,请使用biopython。对于多数据库集成,请使用bi。

4.3

文档转换为Markdown工具

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Skill

将文件和办公文档转换为 Markdown。支持 PDF、DOCX、PPTX、XLSX、图像(带 OCR)、音频(带转录)、HTML、CSV、JSON、XML、ZIP、YouTube URL、EPub 等。

4.2

科学协议管理工具

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Skill

与 protocols.io API 集成以管理科学协议。当与 protocols.io 工作以搜索、创建、更新或发布协议时使用此技能;管理协议步骤和材料;处理讨论和评论;组织工作区;上传和管理文件;或集成其他功能。

4.2

蛋白质结构查询助手

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Skill

访问AlphaFold的超过2亿种AI预测的蛋白质结构。通过UniProt ID检索结构,下载PDB/mmCIF文件,分析置信度指标(pLDDT、PAE),用于药物发现和结构生物学。

4.2

量子计算工具包

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Skill

用于构建、优化和执行量子电路的综合量子计算工具包。在处理量子算法、模拟或量子硬件时使用,包括(1)使用门和测量构建量子电路,(2)运行量子算法(VQE、QAOA、Grover),(3)进行量子电路的优化。

4.2

简化药物发现的Python工具

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Skill

RDKit的Python封装,具有简化的接口和合理的默认设置。适用于标准药物发现:SMILES解析、标准化、描述符、指纹、聚类、3D构象、并行处理。返回原生的rdkit.Chem.Mol对象。对于高级控制或自定义参数,请使用。

4.2

材料科学工具包

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Skill

材料科学工具包。晶体结构(CIF、POSCAR)、相图、能带结构、态密度、材料项目集成、格式转换,用于计算材料科学。

4.2

科学研究多代理AI助手

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Skill

多代理AI系统,用于科学研究辅助,自动化从数据分析到出版的研究工作流程。当从数据集中生成研究想法、开发研究方法、执行计算实验、进行文献搜索时应使用此技能。

4.2

科学可视化绘图工具

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Skill

基础绘图库。创建折线图、散点图、条形图、直方图、热图、3D 图、子图,导出 PNG/PDF/SVG,适用于科学可视化和出版图形。

4.2